скорее всего была установлена программа которая блокирует автозапуск. программа это что то типа антивируса. т.е. вирусы которые бывают на флэшках не установятся сами. вспомните, ничего такого не устанавливали?
Если не запускается автозапуск, нужно зайти в Биос и покопаться там. Там есть такая опция как запуск с которого может запускаться компьютер, с какого диска. Поставьте флажек на диск Е и тогда все должно быть оккейно.